Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVMER34-1Q9H9K5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVMER34-1Q9H9K5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVMER34-1Q9H9K5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVMER34-1Q9H9K5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVMER34-1Q9H9K5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVMER34-1Q9H9K5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVMER34-1Q9H9K5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVMER34-1Q9H9K5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVMER34-1Q9H9K5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms