Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7X7

IFT22, Intraflagellar transport protein 22 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT22Q9H7X7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT22Q9H7X7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT22Q9H7X7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT22Q9H7X7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT22Q9H7X7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms