Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RETREG1Q9H6L5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RETREG1Q9H6L5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RETREG1Q9H6L5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RETREG1Q9H6L5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RETREG1Q9H6L5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RETREG1Q9H6L5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RETREG1Q9H6L5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RETREG1Q9H6L5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RETREG1Q9H6L5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RETREG1Q9H6L5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RETREG1Q9H6L5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RETREG1Q9H6L5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RETREG1Q9H6L5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RETREG1Q9H6L5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RETREG1Q9H6L5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms