Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5U6

ZCCHC4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC4Q9H5U6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC4Q9H5U6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC4Q9H5U6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC4Q9H5U6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC4Q9H5U6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms