Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1DNQ9H478 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNQ1DNQ9H478 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNQ1DNQ9H478 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNQ1DNQ9H478 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNQ1DNQ9H478 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNQ1DNQ9H478 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNQ1DNQ9H478 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNQ1DNQ9H478 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNQ1DNQ9H478 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNQ1DNQ9H478 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNQ1DNQ9H478 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNQ1DNQ9H478 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNQ1DNQ9H478 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms