Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MFSD1Q9H3U5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MFSD1Q9H3U5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MFSD1Q9H3U5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MFSD1Q9H3U5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MFSD1Q9H3U5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MFSD1Q9H3U5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MFSD1Q9H3U5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MFSD1Q9H3U5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MFSD1Q9H3U5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MFSD1Q9H3U5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFSD1Q9H3U5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MFSD1Q9H3U5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFSD1Q9H3U5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFSD1Q9H3U5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms