Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J7

SLC6A15, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT2, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A15Q9H2J7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A15Q9H2J7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC6A15Q9H2J7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A15Q9H2J7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A15Q9H2J7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A15Q9H2J7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A15Q9H2J7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms