Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2H9

SLC38A1, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1Q9H2H9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A1Q9H2H9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A1Q9H2H9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A1Q9H2H9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A1Q9H2H9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A1Q9H2H9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A1Q9H2H9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A1Q9H2H9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A1Q9H2H9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A1Q9H2H9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC38A1Q9H2H9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A1Q9H2H9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A1Q9H2H9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC38A1Q9H2H9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC38A1Q9H2H9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A1Q9H2H9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms