Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRTNQ9H040 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPRTNQ9H040 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRTNQ9H040 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRTNQ9H040 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRTNQ9H040 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms