Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ6

NPFFR1, Neuropeptide FF receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPFFR1Q9GZQ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPFFR1Q9GZQ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPFFR1Q9GZQ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPFFR1Q9GZQ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPFFR1Q9GZQ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPFFR1Q9GZQ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPFFR1Q9GZQ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPFFR1Q9GZQ6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPFFR1Q9GZQ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPFFR1Q9GZQ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPFFR1Q9GZQ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPFFR1Q9GZQ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPFFR1Q9GZQ6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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