Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CIPCQ9C0C6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CIPCQ9C0C6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CIPCQ9C0C6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CIPCQ9C0C6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIPCQ9C0C6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms