Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFAP74Q9C0B2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CFAP74Q9C0B2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CFAP74Q9C0B2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CFAP74Q9C0B2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CFAP74Q9C0B2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CFAP74Q9C0B2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CFAP74Q9C0B2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CFAP74Q9C0B2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CFAP74Q9C0B2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CFAP74Q9C0B2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CFAP74Q9C0B2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CFAP74Q9C0B2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CFAP74Q9C0B2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CFAP74Q9C0B2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CFAP74Q9C0B2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CFAP74Q9C0B2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CFAP74Q9C0B2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CFAP74Q9C0B2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CFAP74Q9C0B2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CFAP74Q9C0B2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CFAP74Q9C0B2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CFAP74Q9C0B2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CFAP74Q9C0B2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CFAP74Q9C0B2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CFAP74Q9C0B2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CFAP74Q9C0B2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CFAP74Q9C0B2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
CFAP74Q9C0B2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CFAP74Q9C0B2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CFAP74Q9C0B2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CFAP74Q9C0B2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CFAP74Q9C0B2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CFAP74Q9C0B2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CFAP74Q9C0B2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CFAP74Q9C0B2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CFAP74Q9C0B2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CFAP74Q9C0B2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CFAP74Q9C0B2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CFAP74Q9C0B2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CFAP74Q9C0B2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CFAP74Q9C0B2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CFAP74Q9C0B2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CFAP74Q9C0B2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CFAP74Q9C0B2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CFAP74Q9C0B2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CFAP74Q9C0B2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CFAP74Q9C0B2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CFAP74Q9C0B2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CFAP74Q9C0B2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CFAP74Q9C0B2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CFAP74Q9C0B2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CFAP74Q9C0B2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CFAP74Q9C0B2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CFAP74Q9C0B2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CFAP74Q9C0B2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CFAP74Q9C0B2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CFAP74Q9C0B2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
CFAP74Q9C0B2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CFAP74Q9C0B2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CFAP74Q9C0B2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CFAP74Q9C0B2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
CFAP74Q9C0B2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CFAP74Q9C0B2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CFAP74Q9C0B2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CFAP74Q9C0B2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CFAP74Q9C0B2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CFAP74Q9C0B2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CFAP74Q9C0B2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CFAP74Q9C0B2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms