Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80BQ9C086 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80BQ9C086 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80BQ9C086 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
INO80BQ9C086 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80BQ9C086 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80BQ9C086 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80BQ9C086 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80BQ9C086 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms