Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM7Q9C029 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM7Q9C029 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM7Q9C029 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM7Q9C029 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM7Q9C029 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM7Q9C029 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM7Q9C029 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM7Q9C029 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms