Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM3Q9BZL3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM3Q9BZL3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM3Q9BZL3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM3Q9BZL3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms