Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PUS3Q9BZE2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PUS3Q9BZE2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PUS3Q9BZE2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PUS3Q9BZE2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PUS3Q9BZE2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PUS3Q9BZE2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PUS3Q9BZE2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PUS3Q9BZE2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PUS3Q9BZE2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PUS3Q9BZE2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PUS3Q9BZE2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PUS3Q9BZE2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PUS3Q9BZE2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PUS3Q9BZE2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PUS3Q9BZE2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PUS3Q9BZE2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PUS3Q9BZE2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PUS3Q9BZE2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PUS3Q9BZE2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PUS3Q9BZE2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PUS3Q9BZE2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PUS3Q9BZE2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PUS3Q9BZE2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PUS3Q9BZE2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PUS3Q9BZE2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PUS3Q9BZE2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms