Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SRRTQ9BXP5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRRTQ9BXP5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SRRTQ9BXP5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SRRTQ9BXP5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRRTQ9BXP5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRRTQ9BXP5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SRRTQ9BXP5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRRTQ9BXP5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRRTQ9BXP5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRRTQ9BXP5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRRTQ9BXP5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRRTQ9BXP5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRRTQ9BXP5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRRTQ9BXP5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRRTQ9BXP5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SRRTQ9BXP5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRRTQ9BXP5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRRTQ9BXP5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRRTQ9BXP5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRRTQ9BXP5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRRTQ9BXP5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRRTQ9BXP5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRRTQ9BXP5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRRTQ9BXP5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRRTQ9BXP5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRRTQ9BXP5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRRTQ9BXP5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRRTQ9BXP5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRRTQ9BXP5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRRTQ9BXP5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRRTQ9BXP5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms