Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LSM14BQ9BX40 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LSM14BQ9BX40 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LSM14BQ9BX40 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LSM14BQ9BX40 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LSM14BQ9BX40 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LSM14BQ9BX40 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSM14BQ9BX40 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms