Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBM4Q9BWF3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM4Q9BWF3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM4Q9BWF3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM4Q9BWF3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM4Q9BWF3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM4Q9BWF3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM4Q9BWF3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms