Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGACTQ9BVM4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGACTQ9BVM4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GGACTQ9BVM4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGACTQ9BVM4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGACTQ9BVM4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GGACTQ9BVM4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GGACTQ9BVM4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms