Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KATNB1Q9BVA0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KATNB1Q9BVA0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KATNB1Q9BVA0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KATNB1Q9BVA0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KATNB1Q9BVA0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KATNB1Q9BVA0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KATNB1Q9BVA0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KATNB1Q9BVA0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KATNB1Q9BVA0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KATNB1Q9BVA0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KATNB1Q9BVA0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KATNB1Q9BVA0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KATNB1Q9BVA0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KATNB1Q9BVA0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms