Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRI1Q9BV20 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRI1Q9BV20 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRI1Q9BV20 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRI1Q9BV20 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRI1Q9BV20 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRI1Q9BV20 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRI1Q9BV20 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRI1Q9BV20 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRI1Q9BV20 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRI1Q9BV20 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRI1Q9BV20 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRI1Q9BV20 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRI1Q9BV20 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRI1Q9BV20 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRI1Q9BV20 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRI1Q9BV20 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms