Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPOQ9BU64 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPOQ9BU64 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPOQ9BU64 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPOQ9BU64 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPOQ9BU64 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPOQ9BU64 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPOQ9BU64 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPOQ9BU64 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms