Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF3Q9BU61 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF3Q9BU61 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFAF3Q9BU61 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDUFAF3Q9BU61 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms