Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C2orf88Q9BSF0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C2orf88Q9BSF0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C2orf88Q9BSF0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
C2orf88Q9BSF0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C2orf88Q9BSF0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms