Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT2

UQCC2, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC2Q9BRT2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UQCC2Q9BRT2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UQCC2Q9BRT2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCC2Q9BRT2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCC2Q9BRT2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UQCC2Q9BRT2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms