Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TREX2Q9BQ50 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TREX2Q9BQ50 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TREX2Q9BQ50 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREX2Q9BQ50 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREX2Q9BQ50 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms