Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3GL2Q99962 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3GL2Q99962 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3GL2Q99962 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3GL2Q99962 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH3GL2Q99962 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH3GL2Q99962 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH3GL2Q99962 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH3GL2Q99962 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3GL2Q99962 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3GL2Q99962 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3GL2Q99962 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3GL2Q99962 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH3GL2Q99962 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3GL2Q99962 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3GL2Q99962 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3GL2Q99962 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH3GL2Q99962 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GL2Q99962 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SH3GL2Q99962 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3GL2Q99962 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3GL2Q99962 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3GL2Q99962 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms