Protein–RNA interactions for Protein: Q99819

ARHGDIG, Rho GDP-dissociation inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGDIGQ99819 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGDIGQ99819 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGDIGQ99819 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGDIGQ99819 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGDIGQ99819 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGDIGQ99819 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGDIGQ99819 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGDIGQ99819 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGDIGQ99819 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGDIGQ99819 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGDIGQ99819 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGDIGQ99819 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGDIGQ99819 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGDIGQ99819 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGDIGQ99819 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGDIGQ99819 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGDIGQ99819 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGDIGQ99819 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGDIGQ99819 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms