Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL13Q99616 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL13Q99616 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL13Q99616 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL13Q99616 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL13Q99616 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms