Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSC22D3Q99576 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC22D3Q99576 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC22D3Q99576 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC22D3Q99576 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC22D3Q99576 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC22D3Q99576 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSC22D3Q99576 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC22D3Q99576 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC22D3Q99576 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC22D3Q99576 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC22D3Q99576 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC22D3Q99576 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC22D3Q99576 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC22D3Q99576 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms