Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1Q96T88 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1Q96T88 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1Q96T88 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1Q96T88 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1Q96T88 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1Q96T88 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1Q96T88 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1Q96T88 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UHRF1Q96T88 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UHRF1Q96T88 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UHRF1Q96T88 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UHRF1Q96T88 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UHRF1Q96T88 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UHRF1Q96T88 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UHRF1Q96T88 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UHRF1Q96T88 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UHRF1Q96T88 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UHRF1Q96T88 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UHRF1Q96T88 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UHRF1Q96T88 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UHRF1Q96T88 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
UHRF1Q96T88 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UHRF1Q96T88 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UHRF1Q96T88 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
UHRF1Q96T88 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UHRF1Q96T88 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
UHRF1Q96T88 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UHRF1Q96T88 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
UHRF1Q96T88 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
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