Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
ARAP1Q96P48 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ARAP1Q96P48 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
ARAP1Q96P48 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ARAP1Q96P48 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
ARAP1Q96P48 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
ARAP1Q96P48 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
ARAP1Q96P48 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
ARAP1Q96P48 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
ARAP1Q96P48 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ARAP1Q96P48 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
ARAP1Q96P48 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
ARAP1Q96P48 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ARAP1Q96P48 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
ARAP1Q96P48 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
ARAP1Q96P48 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
ARAP1Q96P48 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
ARAP1Q96P48 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
ARAP1Q96P48 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
ARAP1Q96P48 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
ARAP1Q96P48 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ARAP1Q96P48 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ARAP1Q96P48 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ARAP1Q96P48 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ARAP1Q96P48 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ARAP1Q96P48 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ARAP1Q96P48 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ARAP1Q96P48 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
ARAP1Q96P48 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
ARAP1Q96P48 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
ARAP1Q96P48 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ARAP1Q96P48 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
ARAP1Q96P48 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC44.25■■■■■ 4.67
ARAP1Q96P48 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.22■■■■■ 4.67
ARAP1Q96P48 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
ARAP1Q96P48 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ARAP1Q96P48 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ARAP1Q96P48 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ARAP1Q96P48 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
ARAP1Q96P48 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
ARAP1Q96P48 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
ARAP1Q96P48 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ARAP1Q96P48 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ARAP1Q96P48 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ARAP1Q96P48 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
ARAP1Q96P48 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
ARAP1Q96P48 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
ARAP1Q96P48 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
ARAP1Q96P48 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ARAP1Q96P48 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
ARAP1Q96P48 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
ARAP1Q96P48 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
ARAP1Q96P48 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
ARAP1Q96P48 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
ARAP1Q96P48 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
ARAP1Q96P48 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
ARAP1Q96P48 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
ARAP1Q96P48 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ARAP1Q96P48 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
ARAP1Q96P48 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ARAP1Q96P48 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC44.02■■■■■ 4.64
ARAP1Q96P48 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
ARAP1Q96P48 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
ARAP1Q96P48 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
ARAP1Q96P48 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
ARAP1Q96P48 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
ARAP1Q96P48 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
ARAP1Q96P48 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ARAP1Q96P48 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
ARAP1Q96P48 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
ARAP1Q96P48 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
ARAP1Q96P48 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms