Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXN4Q96NZ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXN4Q96NZ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXN4Q96NZ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXN4Q96NZ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms