Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF145Q96MT1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF145Q96MT1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF145Q96MT1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF145Q96MT1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms