Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
STAC3Q96MF2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
STAC3Q96MF2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
STAC3Q96MF2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
STAC3Q96MF2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
STAC3Q96MF2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
STAC3Q96MF2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
STAC3Q96MF2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
STAC3Q96MF2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.27■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
STAC3Q96MF2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
STAC3Q96MF2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
STAC3Q96MF2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
STAC3Q96MF2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
STAC3Q96MF2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
STAC3Q96MF2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
STAC3Q96MF2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
STAC3Q96MF2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
STAC3Q96MF2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
STAC3Q96MF2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
STAC3Q96MF2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
STAC3Q96MF2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
STAC3Q96MF2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
STAC3Q96MF2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
STAC3Q96MF2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
STAC3Q96MF2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
STAC3Q96MF2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
STAC3Q96MF2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
STAC3Q96MF2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
STAC3Q96MF2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
STAC3Q96MF2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
STAC3Q96MF2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
STAC3Q96MF2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
STAC3Q96MF2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
STAC3Q96MF2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
STAC3Q96MF2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
STAC3Q96MF2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
STAC3Q96MF2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
STAC3Q96MF2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
STAC3Q96MF2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
STAC3Q96MF2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
STAC3Q96MF2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
STAC3Q96MF2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
STAC3Q96MF2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
STAC3Q96MF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
STAC3Q96MF2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
STAC3Q96MF2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms