Protein–RNA interactions for Protein: Q96L50

LRR1, Leucine-rich repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRR1Q96L50 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRR1Q96L50 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRR1Q96L50 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRR1Q96L50 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRR1Q96L50 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRR1Q96L50 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRR1Q96L50 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRR1Q96L50 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRR1Q96L50 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRR1Q96L50 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRR1Q96L50 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRR1Q96L50 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRR1Q96L50 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRR1Q96L50 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRR1Q96L50 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRR1Q96L50 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRR1Q96L50 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRR1Q96L50 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRR1Q96L50 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRR1Q96L50 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRR1Q96L50 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRR1Q96L50 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRR1Q96L50 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRR1Q96L50 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRR1Q96L50 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRR1Q96L50 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRR1Q96L50 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRR1Q96L50 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRR1Q96L50 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms