Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM71F1Q96KD3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71F1Q96KD3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM71F1Q96KD3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71F1Q96KD3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM71F1Q96KD3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71F1Q96KD3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71F1Q96KD3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71F1Q96KD3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71F1Q96KD3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71F1Q96KD3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71F1Q96KD3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71F1Q96KD3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71F1Q96KD3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71F1Q96KD3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71F1Q96KD3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71F1Q96KD3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms