Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAX2Q96IS3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAX2Q96IS3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAX2Q96IS3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAX2Q96IS3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms