Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
BCANQ96GW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
BCANQ96GW7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
BCANQ96GW7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
BCANQ96GW7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
BCANQ96GW7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
BCANQ96GW7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
BCANQ96GW7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
BCANQ96GW7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
BCANQ96GW7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
BCANQ96GW7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
BCANQ96GW7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
BCANQ96GW7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
BCANQ96GW7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
BCANQ96GW7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
BCANQ96GW7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
BCANQ96GW7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.69■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
BCANQ96GW7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
BCANQ96GW7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
BCANQ96GW7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
BCANQ96GW7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
BCANQ96GW7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
BCANQ96GW7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
BCANQ96GW7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
BCANQ96GW7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
BCANQ96GW7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
BCANQ96GW7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
BCANQ96GW7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
BCANQ96GW7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
BCANQ96GW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
BCANQ96GW7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
BCANQ96GW7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
BCANQ96GW7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
BCANQ96GW7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
BCANQ96GW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
BCANQ96GW7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms