Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGAP3Q96FM1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PGAP3Q96FM1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGAP3Q96FM1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PGAP3Q96FM1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PGAP3Q96FM1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PGAP3Q96FM1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGAP3Q96FM1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGAP3Q96FM1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGAP3Q96FM1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGAP3Q96FM1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms