Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGTBQ96EQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGTBQ96EQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTBQ96EQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTBQ96EQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTBQ96EQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGTBQ96EQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGTBQ96EQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SGTBQ96EQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGTBQ96EQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGTBQ96EQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGTBQ96EQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGTBQ96EQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGTBQ96EQ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGTBQ96EQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGTBQ96EQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGTBQ96EQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGTBQ96EQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGTBQ96EQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGTBQ96EQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGTBQ96EQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGTBQ96EQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGTBQ96EQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms