Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERP27Q96DN0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERP27Q96DN0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERP27Q96DN0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP27Q96DN0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms