Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO6Q96DC7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO6Q96DC7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO6Q96DC7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO6Q96DC7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO6Q96DC7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO6Q96DC7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO6Q96DC7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO6Q96DC7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO6Q96DC7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO6Q96DC7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms