Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCDCQ96CD2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPCDCQ96CD2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPCDCQ96CD2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPCDCQ96CD2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPCDCQ96CD2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPCDCQ96CD2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPCDCQ96CD2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPCDCQ96CD2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPCDCQ96CD2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPCDCQ96CD2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms