Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms