Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPTQ96BT3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPTQ96BT3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPTQ96BT3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPTQ96BT3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPTQ96BT3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPTQ96BT3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPTQ96BT3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPTQ96BT3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPTQ96BT3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPTQ96BT3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPTQ96BT3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPTQ96BT3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPTQ96BT3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPTQ96BT3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPTQ96BT3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPTQ96BT3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPTQ96BT3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPTQ96BT3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPTQ96BT3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPTQ96BT3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPTQ96BT3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPTQ96BT3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPTQ96BT3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPTQ96BT3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPTQ96BT3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPTQ96BT3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPTQ96BT3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPTQ96BT3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPTQ96BT3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPTQ96BT3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPTQ96BT3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPTQ96BT3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPTQ96BT3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPTQ96BT3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms