Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TP53INP1Q96A56 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TP53INP1Q96A56 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TP53INP1Q96A56 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TP53INP1Q96A56 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TP53INP1Q96A56 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TP53INP1Q96A56 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TP53INP1Q96A56 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TP53INP1Q96A56 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TP53INP1Q96A56 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TP53INP1Q96A56 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TP53INP1Q96A56 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TP53INP1Q96A56 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TP53INP1Q96A56 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms