Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTSSAQ969W0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTSSAQ969W0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTSSAQ969W0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTSSAQ969W0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms