Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HPS3Q969F9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HPS3Q969F9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HPS3Q969F9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HPS3Q969F9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HPS3Q969F9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HPS3Q969F9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HPS3Q969F9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HPS3Q969F9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HPS3Q969F9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HPS3Q969F9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HPS3Q969F9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HPS3Q969F9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HPS3Q969F9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPS3Q969F9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPS3Q969F9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
HPS3Q969F9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HPS3Q969F9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HPS3Q969F9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS3Q969F9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HPS3Q969F9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HPS3Q969F9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HPS3Q969F9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HPS3Q969F9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HPS3Q969F9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms